医薬品の副作用報告は、医師の判断に基づき医療機関から製薬会社に寄せられ、その後、会社から国に届く。同省は年に３、４回開く、薬事・食品衛生審議会の医薬品等安全対策部会で、最新の副作用事例をまとめた資料を配布し、死亡例など重大とみられる事例について分析をしている。
最近１０回の部会にはかられた副作用報告（０３年７月〜０６年１２月分）を集計したところ、「精神・神経症状」にあたる副作用が約２８０件あった。内訳は、意識レベルの低下や失神などの「意識障害」が６３件、転落などの「異常行動」が４６件、幻覚などを起こす「せんもう」が３１件など。「自殺未遂」２件や「落ち着きのなさ」７件なども含まれていた。
このほか、突然死６件、骨折４件、脳挫傷１件などがあった。骨折や脳挫傷は、転落や転倒などの異常行動が原因だった可能性もある。
同省がこれまで公表している飛び降り・転落などの異常行動は１０代の１６件と、成人の７件の計２３件にとどまっている。
同省は０４年５月、１０代の少女が服用後に窓から飛び降りようとし、家族が防ぐという事例などがあったとして、タミフルの添付文書の重大な副作用項目に「精神・神経症状」を加えるよう、輸入販売元の中外製薬に改訂を指示していた。
ただ、このケースの後も副作用について、死亡例以外は深く掘り下げていなかった。厚労省は「医薬品全体の副作用報告は１日平均２００件もあるため、死亡例を中心に分析してきた。今回の問題を受けて、約１８００件のすべてを再調査する」としている。